Estudio de la contribución genómica al envejecimiento mediante modelos fisiológicamente relevantes

Resum

El envejecimiento es un proceso multifactorial que conduce a la disminución progresiva de la aptitud biológica de los individuos en la mayoría de los organismos multicelulares. Durante este proyecto de Tesis, hemos desarrollado análisis genómicos comparativos en especies representativas como tortugas gigantes, buscando pistas sobre los rasgos relacionados con la longevidad. Describimos diversos eventos genómicos como duplicaciones, mutaciones puntuales y nuevos genes con posibles roles en cáncer e inmunidad. Como ejemplo, describimos la evolución de PRF1, un gen que codifica una proteína formadora de poros con funciones en la respuesta inmune contra bacterias o células infectadas por virus, cáncer o células senescentes. De esta forma, estudiamos los genomas de más de 80 especies que nos permitieron obtener cerca de 400 genes homólogos a PRF1 utilizando nuestro proceso de anotación con supervisión manual. Por otro lado, tratamos de estudiar el papel de las mutaciones somáticas durante el envejecimiento. Secuenciando células descendientes de trasplantes de médula ósea en un modelo de ratón microquimérico y células madre adultas expandidas clonalmente, obtuvimos el conjunto de mutaciones somáticas acumuladas durante la vida en unas pocas células madre. Además, la comparativa de las cargas mutacionales presentes en células madre de un modelo de ratón de envejecimiento prematuro, nos permitió proporcionar evidencia directa de protección contra la inestabilidad genómica en células hematopoyéticas de ratones progeroides.