Organización genómica del aislado ast/89 del virus de la enfermedad hemorrágica de los conejos

Resumen

EL VIRUS DE LA ENFERMEDAD HEMORRAGICA DE LOS CONEJOS (RHDV) ES EL AGENTE CAUSAL DE UNA ENFERMEDAD ALTAMENTE CONTAGIOSA (ENFERMEDAD HEMORRAGICA VIRICA DEL CONEJO), LA CUAL SURGIO POR PRIMERA VEZ EN CHINA DURANTE EL AÑO 1984, DESDE DONDE SE EXTENDIO A LO LARGO DE AMERICA, AFRICA Y EUROPA.LA CARACTERIZACION A NIVEL PROTEICO DEL RHDV AST/89 PERMITIO REALIZAR LA ASIGNACION DEFINITIVA DE ESTE VIRUS A LA FAMILIA CALICIVIRIDAE. LAS PARTICULAS VIRALES ESTAN FORMADAS POR UN UNICO POLIPEPTIDO, CUYA MASA MOLECULAR ES DE APROXIMADAMENTE 60 KDA (VP60). EL MATERIAL GENETICO EXTRAIDO DE LOS VIRIONES ESTA FORMADO POR DOS ESPECIES DE RNA MONOCATENARIO, INFECTIVO, DE POLARIDAD POSITIVA, POLIADENILADO DE 7,5 KB Y 2,2 KB. EL RNA SUBGENOMICO DE 2,2 KB ES COTERMINAL POR SU EXTREMO 3' CON EL RNA GENOMICO Y SU FUNCION BIOLOGICA ES LA CODIFICACION DE LA VP60. LOS EXPERIMENTOS PLANTEADOS EN ESTE TRABAJO VAN DIRIGIDOS AL ESTUDIO DE LA ORGANIZACION GENOMICA Y DE LAS ESTRATEGIAS DE EXPRESION GENICA UTILIZADAS POR ESTE VIRUS PARA COMPLETAR CON EXITO SU CICLO INFECTIVO. EL RNA GENOMICO DEL RHDV AST/89 CONSISTE EN 7437 NT EXCLUYENDO LA COLA DE POLI-A. EN ESTE RNA SE DETECTARON DOS POSIBLES PAUTAS ABIERTAS DE LECTURA (ORFS): LA ORF1 QUE ABARCA EL 94% DE LA LONGITUD GLOBAL DEL GENOMA Y TIENE CAPACIDAD PARA CODIFICAR UN POLIPEPTIDO DE 256 KDA Y LA ORF2 LOCALIZADA CERCA DEL EXTREMO 3' DEL RNA GENOMICO CON CAPACIDAD PARA CODIFICAR UNA HIPOTETICA PROTEINA DE 13 KDA. EL POLIPEPTIDO DERIVADO DE LA ORF1 PRESENTA TRES REGIONES DE HOMOLOGIA SIGNIFICATIVA A LOS PEPTIDOS 2C, 3C Y 3D DE PICORNAVIRUS CON FUNCIONES DE RNA HELICASA, CISTEIN PROTEASA Y RNA POLIMERASA RNA DEPENDIENTE RESPECTIVAMENTE. LA REGION CARBOXILO TERMINAL DE ESTE POLIPEPTIDO CONTIENE LA SECUENCIA CODIFICADORA DE LA VP60. SE HA DEMOSTRADO TANTO IN VITRO COMO EN E. COLI QUE LA REGION GENOMICA QUE PRESENTA HOMOLOGIA CON EL PEPTIDO 3C DE PICORNAVIRUS CODIFICA UNA CISTEIN PROTEASA. ESTA CATALIZA LA ESCI