Desarrollo de nuevas metodologías para el análisis bioinformático de genomas

Resum

La secuenciación del genoma humano ha permitido el desarrollo de numerosas tecnologías que permiten acelerar la identificación de genes implicados en distintas patologías humanas, incluyendo enfermedades hereditarias, neurodegenerativas, cardiovasculares y oncológicas. Las tecnologías de ultrasecuenciación permiten la detección de variación genética de animales endogámicos como la rata hipertensa SHR. La comparación con el genoma de referencia de la rata Brown Norway (BN) ha permitido identificar más de 3,6 millones de polimorfismos de un único nucleótido y más de 340.000 polimorfismos de pequeñas inserciones/deleciones diferenciando ambas cepas. Numerosos genes (788) han sufrido mutaciones en la secuencia codificante en la cepa SHR (60 de ellos completamente ausentes en esta cepa), y algunos de ellos, como Cd36, previamente implicados en hipertensión. Los cambios identificados facilitarán futuros estudios sobre la base genética del fenotipo de este modelo animal. Asimismo, la presencia de polimorfismos en regiones asociadas a cambios en la expresión génica entre SHR y BN, podría explicar las diferencias en la regulación de la expresión génica entre ambas cepas. Estos datos refuerzan la utilidad de las técnicas de resecuenciación de modelos animales para profundizar en el conocimiento de las bases moleculares de la enfermedad humana.