Análisis bioinformático y transcriptomico de genomas y degradomasaplicación al estudio del cáncer y de la evolución
- Rodríguez Ordoñez, Gonzalo
- Xosé A. Suárez Puente Director
- Carlos López Otín Director
Defence university: Universidad de Oviedo
Fecha de defensa: 18 June 2010
- Antonio Manuel Fueyo Silva Chair
- José M. P. Freije Secretary
- Juan Cadiñanos Bañales Committee member
- Ignacio Varela Egocheaga Committee member
- David Torrents Arenales Committee member
Type: Thesis
Abstract
El análisis bioinformático de los genomas del chimpancé, el orangután y el ornitorrinco, y su comparación con el genoma humano y los de otros mamíferos modelo, nos ha permitido identificar un conjunto de genes de proteasas diferenciales entre estas especies. Dichos genes participan fundamentalmente en procesos relacionados con la respuesta inmune, la reproducción y la digestión. Se ha diseñado una plataforma microfluídica para el análisis de la expresión de los genes de proteasas, y se ha aplicado al estudio del cáncer de colon, contribuyendo a la identificación de nuevos genes asociados con la progresión tumoral. Finalmente, el análisis de distintos genomas tumorales ha revelado la existencia de numerosas mutaciones somáticas en el DNA mitocondrial, que podrían participar en el proceso de transformación maligna.